正常女性阴道中多种微生物与宿主之间保持着动态平衡，微生物相互之间也保持着动态平衡，一旦平衡被打破，各种的妇科疾病也会随之而来。由于阴道微生态评价内容较多，评价的方法也多种多样，形成统一的检测指标对女性生殖道微生态体系进行评价。因此我们在阴道微生态的科学评价对疾病的诊断中，积极探索治疗有深远意义。
阴道微生态评价系统阴道微生态评价指标
阴道菌群密集度反应标本中细菌分布、排列的密集程度，可以反应出某微生态区域中菌群总生物量的多少。评估涂片中所有细菌种类的多少，了解阴道微生态的复杂性主要是看阴道菌群多样性。而在阴道微生态评价指标中优势菌在很大程度上影响着整个菌群的功能且其对宿主的生理病理影响最大，是菌群中生物量或种群密集度最大的细菌，油镜下所见最多的微生物可以定义为优势菌。若阴道分泌物样本观察可检测病原微生物，如酵母菌孢子、酵母菌假菌丝、阴道毛滴虫等，这些病原微生物的存在与否及其数量，对于诊断阴道炎症具有重要意义。
阴道微生态综合评价系统阴道微生态判断标准
正常阴道微生态 阴道菌群密集度II级或III级，菌群多样，优势菌种是乳酸杆菌，阴道微生物的功能正常，阴道清洁度I度，阴道PH值≤4.5
阴道微生态评价系统阴道微生态失调
阴道菌群密集度、阴道菌群多样性、阴道优势菌、炎性反应、阴道PH值以及阴道微生物功能中任何一项出现异常，可诊断为阴道微生态失调。
生殖道感染的情况多见，并发症较多，部分女性虽然有阴道炎症状，但阴道未明确致病菌患者阴道内菌群是正常的，但在以前这种情况常被误解为阴道炎，因此使用阴道微生态综合评价系统可以协助临床快速检验阴道炎症，并给予指导以达到治疗生殖道感染的目的。同时可以更准确的知道患者纠正不正确的生活方式及卫生习惯，降低生殖道感染的复发率，维护女性生殖道健康。